北京工商大学获得在职读研硕士学位授予权，是我国第一批获得在职考研硕士学位授予权的高校，并具有博士研究生联合招生与培养权，学校大力加强学科建设，现有北京市重点学科2个，重点建设学科4个。在职硕士学位授权点从合校之初的16个，发展到目前的2个一级学科和35个二级学科硕士学位授权点，以及4个硕士专业学位授予权。2个一级学科硕士点为：应用经济学和环境科学与工程；35个二级学科在职研究生硕士学位授权点为：政治经济学、西方经济学、国民经济学、区域经济学、产业经济学、财政学、金融学、国际贸易学、劳动经济学、数量经济学、国防经济学、会计学、企业管理（财务管理）、统计学、企业管理、旅游管理、技术经济及管理、管理科学与工程（具有管理学、工学两个学科门类硕士学位授予权）、民商法学、经济法学、专门史、应用化学、生物化工、环境工程、环境科学、食品科学、材料加工工程、控制理论与控制工程、检测技术与自动化装置、计算机应用技术、机械设计及理论、机械制造及其自动化、马克思主义中国化研究、思想政治教育、新闻学，涉及经济学、管理学、法学、历史学、文学和工学6个学科领域；北京工商大学在职研究生有工商管理硕士MBA及机械工程、控制工程、化学工程等领域的工程硕士专业学位授予权。
北工商积极推动面向国家及首都经济建设与社会发展的科技工作，在应用研究、高新技术及其产业化等方面取得了可喜的成果，获奖数量位居北京市属市管院校前列，具有较强的科研和创新实力。学校大力加强在职研究生师资队伍尤其是导师队伍的建设。建立了严格的硕士生导师遴选制度，不断完善导师的教书育人和科研水平评价体系，现有硕士生导师222人。同时，严把在职研究生培养质量关，实行全方位全过程全要素的研究生质量管理体系，注重培养在职研究生科研能力和创新能力。
北京工商大学立足北京，服务首都，面向全国，正在加快学科建设和调整，向着建设工商融合、文理渗透的教学研究型大学的方向迈进。北京工商大学研究生处（部）将进一步适应市场经济对高层次人才的要求，加强学科建设和研究生教育，深化改革，积极吸收国内外先进办学经验，培养出更多更优秀的在职研究生，为把北京工商大学建设成为教学研究型大学贡献力量。
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